В Башгоспедуниверситете имени Акмуллы работает делегация представителей вузов ЛНР, ДНР, Херсонской и Запорожской областей, Минобрнауки возвращенных российских территорий. Республику Башкортостан и университет связывают особые отношения с Луганской Народной Республикой.
Вуз сотрудничает с двумя школами региона. Башгоспедуниверситет подписал соглашения с четырьмя высшими учебными заведениями возвращенных российских территорий.